Caracterización de ORFs 94, 75 y 125 y virulencia de aislados de WSSV obtenidos del sur de Guasave, Sinaloa durante 2011

Propiedades

Título

Caracterización de ORFs 94, 75 y 125 y virulencia de aislados de WSSV obtenidos del sur de Guasave, Sinaloa durante 2011

Autor

Jesús Adrián de la Rosa Lizárraga

Director de Tesis

Norberto Vibanco Pérez

Palabras clave

Camarones - -- Cultivo - -- Tesis y disertaciones académicas Acuicultura - -- Tesis y disertaciones académicas

Fecha de titulación

2014

Editorial

Universidad Autónoma de Nayarit

Resumen

Objetivo:Genotipificar los aislados del Virus del Síndrome de la Mancha Blanca (WSSV) obtenidos de camarones (Litopenaeus vannamei) en el sur de Guasave, Sinaloa, durante los ciclos de cultivo 2011 y 2012, mediante el análisis de las regiones de los marcos de lectura abiertos ORF 94, ORF 75 y ORF 125, para evaluar la relación entre la variabilidad genómica del virus y los niveles de mortalidad en las granjas. Metodología:Se recolectaron 168 camarones con sintomatología clínica en 8 granjas camaronícolas con brotes de la enfermedad. La presencia del virus se confirmó mediante PCR anidada. De las 104 muestras que resultaron positivas a WSSV (62% de prevalencia), se amplificaron los marcadores genéticos ORF 94, ORF 75 y ORF 125 mediante PCR empleando enzimas de alta fidelidad, seguidos de purificación y secuenciación automática. Se determinaron los haplotipos en función del número de unidades de repetición (URs) y la presencia de polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs). Finalmente, se realizó una prueba de correlación de Spearman ($p < 0.05$) para asociar los haplotipos virales con los datos de mortalidad de cada estanque.

Programa educativo

Químico Farmacobiólogo