Camparación genotípica del WSSv entre granjas de camarón en el Estado de Nayarit durante 2009

Propiedades

Título

Camparación genotípica del WSSv entre granjas de camarón en el Estado de Nayarit durante 2009

Autor

Zulia Fernandina Nieves López

Director de Tesis

Ma. de Jesús Duran Avelar

Palabras clave

Cultivo de mariscos - -- Tesis y disertaciones académicas Camarones - -- Tesis y disertaciones académicas

Fecha de titulación

2012

Editorial

Universidad Autónoma de Nayarit

Resumen

El Virus del Síndrome de la Mancha Blanca (WSSV) es uno de los patógenos más devastadores en la industria camaronícola. El objetivo de este trabajo fue establecer las diferencias genotípicas entre aislados del WSSV recolectados en la zona sur (San Blas) en comparación con las zonas norte y centro del estado de Nayarit durante el año 2009, empleando como marcadores moleculares las regiones ORF94, ORF125, ORF75 y la secuencia del gen de la transposasa. Se analizaron 41 aislados virales obtenidos de camarones cultivados en las tres regiones camaronícolas durante el periodo de julio a diciembre de 2009. La presencia del WSSV se confirmó al 100% mediante PCR anidada, procediendo posteriormente a la amplificación y secuenciación de los marcadores genéticos seleccionados para identificar polimorfismos de un solo nucleótido (SNPs) y variaciones en las unidades de repetición (URs). Los resultados mostraron que el marcador ORF94 presentó la mayor variabilidad genética, identificándose 9 genotipos distintos en función del cambio de base en la posición 48 de las URs. El genotipo denominado 8B estuvo presente tanto en la zona norte como en la sur, mientras que los genotipos de 5, 7, 8A y 9A fueron exclusivos de la zona norte; los genotipos 8C y 9B se registraron únicamente en la zona sur (San Blas), y amplicones con 12 o más URs pertenecieron exclusivamente a la zona centro. Para la región ORF125 solo se obtuvieron amplicones en la zona sur (con 8 URs y sustituciones nucleotídicas específicas). Respecto a ORF75, los aislados de la zona sur mostraron un patrón homogéneo de 12 URs (9 de 45 pb y 3 de 102 pb), a diferencia de la zona centro que presentó 11 URs. Por último, el análisis del marcador del gen de la transposasa reveló la ausencia de dicho gen en la totalidad de los aislados analizados.

Programa educativo

Químico Farmacobiólogo