Genotipificación del virus del síndrome de la mancha blanca mediante el análisis del ORF94, en aislados obtenidos en el periodo 2007-2009 en Nayarit

Propiedades

Título

Genotipificación del virus del síndrome de la mancha blanca mediante el análisis del ORF94, en aislados obtenidos en el periodo 2007-2009 en Nayarit

Autor

Mayra Cristina Ríos Medrano

Director de Tesis

Norberto Vivanco Pérez

Palabras clave

Genética viral - -- Tesis y disertaciones académicas Camarones - -- Enfermedades - -- Tesis y disertaciones académicas

Fecha de titulación

2010

Editorial

Universidad Autónoma de Nayarit

Resumen

El presente trabajo de investigación tuvo como objetivo establecer las diferencias genéticas del virus del síndrome de la mancha blanca (WSSV) en aislados obtenidas entre enero de 2007 y junio de 2009 en granjas camaronícolas del estado de Nayarit, mediante la evaluación del número de unidades de repetición (URs) y la secuencia de nucleótidos en el marco de lectura abierto ORF94. La metodología comprendió el análisis de 140 aislados virales provenientes de camarones Litopenaeus vannamei recolectados en dos regiones acuícolas de la entidad (Zona Norte y Zona Centro), reconfirmando la presencia del virus mediante PCR anidada y amplificando la región variable ORF94 por PCR de punto final. La región ORF94 se amplificó exitosamente en el 65% (91/140) de las muestras confirmadas, observándose variaciones en el tamaño de los amplicones que correspondieron a 15 números teóricos de URs dentro de un rango de 7 a 23 repeticiones. La frecuencia del número de URs varió según el año de muestreo: 9 URs en 2007, 10 URs en 2008 y 20 URs en 2009, identificándose asociaciones estadísticamente significativas entre el tamaño del amplicón, el año y la zona geográfica. La secuenciación nucleotídica de 16 amplicones confirmó la estructura en tándem de 54 pb y la presencia del polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) T/G en la posición 48. Se concluye que el marcador molecular ORF94 es una herramienta eficaz para discriminar variantes genotípicas de WSSV, evidenciando una mayor diversidad y variabilidad genética en la zona norte del estado de Nayarit.

Programa educativo

Químico Farmacobiólogo