Aislamiento de bacterias a partir de composta de cuye (Cavia porcellus) y su identificación por reacción en cadena de la polimerasa y secuenciación

Propiedades

Título

Aislamiento de bacterias a partir de composta de cuye (Cavia porcellus) y su identificación por reacción en cadena de la polimerasa y secuenciación

Autor

Ricardo Leonel Valderrama Moreno

Director de Tesis

Sergio Martínez González, Carlos Alfredo Carmona Gasca

Palabras clave

Compost -- Tesis y disertaciones académicas Reodores -- Tesis y disertaciones académicas Bacterias -- Tesis y disertaciones académicas

Fecha de titulación

2018

Editorial

Universidad Autónoma de Nayarit

Resumen

El presente trabajo de investigación evaluó la diversidad bacteriana mesófila aislada a partir de composta de estiércol de cuye (Cavia porcellus), mediante recuentos microbiológicos estándar e identificación molecular por reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y secuenciación de la región variable 3 (V3) del gen ARNr 16S. En los análisis cuantitativos se determinaron conteos de 562 666 666.67 unidades formadoras de colonias por mililitro (UFC/ml) para mesófilos totales y de 594 000 000 UFC/ml para enterobacterias. Se recuperaron 10 aislados puros en cultivo, los cuales comprenden 2 géneros de bacterias Gram negativas y 8 de bacterias Gram positivas. La secuenciación e identificación filogenética reveló que las enterobacterias Gram negativas correspondieron a Klebsiella pneumoniae (con la mayor prevalencia, 96.88%) y Enterobacter cloacae (2.64%). Por su parte, las bacterias Gram positivas representaron menos del 1% del total aislable pero mostraron mayor diversidad genérica, perteneciendo todas al género Bacillus (B. altitudinis, B. aerophilus, B. aryabhattai, B. stratosphericus, B. megaterium, B. pumilus, B. safensis y B. cereus). Se concluye que el proceso de compostaje de excretas de cuye presenta un microbioma mixto propio compuesto por bacterias ambientales y microorganismos oportunistas de importancia en salud animal y humana, siendo la ribotipificación una herramienta precisa para su identificación.

Programa educativo

Médico Veterinario Zootecnista